Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA3P26006 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms