Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
USF1P22415 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF1P22415 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF1P22415 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF1P22415 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF1P22415 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF1P22415 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF1P22415 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF1P22415 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF1P22415 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF1P22415 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USF1P22415 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USF1P22415 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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