Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNA2P20248 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms