Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFTRP13569 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CFTRP13569 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CFTRP13569 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFTRP13569 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFTRP13569 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFTRP13569 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CFTRP13569 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CFTRP13569 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CFTRP13569 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CFTRP13569 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFTRP13569 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFTRP13569 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CFTRP13569 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CFTRP13569 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFTRP13569 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFTRP13569 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CFTRP13569 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CFTRP13569 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms