Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms