Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD8BP10966 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD8BP10966 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD8BP10966 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms