Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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