Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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