Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCNDBP1O95273 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CCNDBP1O95273 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CCNDBP1O95273 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNDBP1O95273 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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