Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F6O75461 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F6O75461 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F6O75461 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F6O75461 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F6O75461 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F6O75461 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F6O75461 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F6O75461 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms