Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNSO60931 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms