Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EDIL3O43854 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EDIL3O43854 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms