Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRTO14522 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRTO14522 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
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