Protein–RNA interactions for Protein: F5GYI3

UBAP1L, Ubiquitin-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1LF5GYI3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBAP1LF5GYI3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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