Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms