Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms