Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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