Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3CA6NKF2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3CA6NKF2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms