Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSDA5PKW4 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms