Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EME2A4GXA9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EME2A4GXA9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms