Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIPSLA2A3N6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms