Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
U3KQV3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
U3KQV3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQV3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQV3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQV3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQV3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQV3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQV3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQV3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQV3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQV3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQV3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
U3KQV3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQV3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQV3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQV3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQV3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U3KQV3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQV3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQV3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQV3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQV3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQV3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQV3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQV3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQV3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQV3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U3KQV3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U3KQV3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U3KQV3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U3KQV3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U3KQV3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U3KQV3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U3KQV3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U3KQV3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U3KQV3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U3KQV3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U3KQV3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U3KQV3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U3KQV3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U3KQV3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U3KQV3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U3KQV3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQV3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQV3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQV3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQV3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQV3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQV3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQV3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQV3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQV3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQV3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQV3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U3KQV3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
U3KQV3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
U3KQV3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U3KQV3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U3KQV3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U3KQV3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U3KQV3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U3KQV3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
U3KQV3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
U3KQV3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U3KQV3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U3KQV3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U3KQV3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U3KQV3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQV3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQV3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQV3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQV3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQV3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQV3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQV3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQV3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQV3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQV3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQV3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U3KQV3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U3KQV3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U3KQV3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U3KQV3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
U3KQV3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
U3KQV3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U3KQV3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
U3KQV3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
U3KQV3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
U3KQV3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U3KQV3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U3KQV3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
U3KQV3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U3KQV3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
U3KQV3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
U3KQV3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U3KQV3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
U3KQV3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U3KQV3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U3KQV3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms