Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIC4Q9Y696 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIC4Q9Y696 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLIC4Q9Y696 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLIC4Q9Y696 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms