Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX8Q9Y5X2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX8Q9Y5X2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX8Q9Y5X2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms