Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAI2Q9Y5P3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAI2Q9Y5P3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAI2Q9Y5P3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms