Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K3

PCYT1B, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1BQ9Y5K3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCYT1BQ9Y5K3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCYT1BQ9Y5K3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms