Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN16Q9Y5I7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN16Q9Y5I7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN16Q9Y5I7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms