Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
AFG3L2Q9Y4W6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFG3L2Q9Y4W6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms