Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRRAPQ9Y4A5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRRAPQ9Y4A5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRRAPQ9Y4A5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms