Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF3AQ9Y496 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIF3AQ9Y496 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIF3AQ9Y496 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms