Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
R3HCC1Q9Y3T6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
R3HCC1Q9Y3T6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
R3HCC1Q9Y3T6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HCC1Q9Y3T6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms