Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HCN4Q9Y3Q4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HCN4Q9Y3Q4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms