Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MRPL11Q9Y3B7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MRPL11Q9Y3B7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPL11Q9Y3B7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms