Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIKFYVEQ9Y2I7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms