Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNND2Q9UQB3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNND2Q9UQB3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms