Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ84

EXO1, Exonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO1Q9UQ84 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXO1Q9UQ84 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXO1Q9UQ84 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EXO1Q9UQ84 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXO1Q9UQ84 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXO1Q9UQ84 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXO1Q9UQ84 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXO1Q9UQ84 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXO1Q9UQ84 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXO1Q9UQ84 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXO1Q9UQ84 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXO1Q9UQ84 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXO1Q9UQ84 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXO1Q9UQ84 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXO1Q9UQ84 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EXO1Q9UQ84 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXO1Q9UQ84 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms