Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN6Q9UQ52 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN6Q9UQ52 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN6Q9UQ52 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms