Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC12A4Q9UP95 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC12A4Q9UP95 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC12A4Q9UP95 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms