Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
DENND2AQ9ULE3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DENND2AQ9ULE3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DENND2AQ9ULE3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DENND2AQ9ULE3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms