Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SARDHQ9UL12 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARDHQ9UL12 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARDHQ9UL12 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SARDHQ9UL12 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms