Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM4Q9UKN5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDM4Q9UKN5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM4Q9UKN5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms