Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD2Q9UKL4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GJD2Q9UKL4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJD2Q9UKL4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms