Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRTO4Q9UKD2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRTO4Q9UKD2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms