Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCTN4Q9UJW0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCTN4Q9UJW0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCTN4Q9UJW0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms