Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRLS1Q9UJA2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRLS1Q9UJA2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRLS1Q9UJA2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms