Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
STAG3Q9UJ98 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
STAG3Q9UJ98 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
STAG3Q9UJ98 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
STAG3Q9UJ98 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
STAG3Q9UJ98 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
STAG3Q9UJ98 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
STAG3Q9UJ98 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
STAG3Q9UJ98 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
STAG3Q9UJ98 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
STAG3Q9UJ98 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
STAG3Q9UJ98 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
STAG3Q9UJ98 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
STAG3Q9UJ98 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
STAG3Q9UJ98 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
STAG3Q9UJ98 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
STAG3Q9UJ98 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
STAG3Q9UJ98 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
STAG3Q9UJ98 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
STAG3Q9UJ98 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms