Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HACL1Q9UJ83 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HACL1Q9UJ83 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HACL1Q9UJ83 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HACL1Q9UJ83 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HACL1Q9UJ83 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HACL1Q9UJ83 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms