Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEFF2Q9UIK5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEFF2Q9UIK5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEFF2Q9UIK5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEFF2Q9UIK5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms