Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIC8

LCMT1, Leucine carboxyl methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCMT1Q9UIC8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LCMT1Q9UIC8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCMT1Q9UIC8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCMT1Q9UIC8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCMT1Q9UIC8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCMT1Q9UIC8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms