Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPS1Q9UHF7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPS1Q9UHF7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPS1Q9UHF7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms